Wellcome Sanger Institute、Parse Biosciences 與 Helmholtz Munich 的 Computational Health Center 今日宣布建立合作，致力于構建單細胞圖譜基礎項目，重點研究癌癥治療反應中的可塑性機制。該合作將為后續(xù)開發(fā)涵蓋數(shù)億細胞的癌癥可塑性圖譜奠定基礎。
通過創(chuàng)新的類器官擾動模型和人工智能（AI）平臺，該項目旨在創(chuàng)建一個全面的數(shù)據(jù)集，為基礎藥物發(fā)現(xiàn)模型和癌癥研究提供支持。
Sanger Institute 團隊負責人 Mathew Garnett 博士和 Helmholtz Munich 的 Computational Health Center 主任、Sanger Institute 副教授 Fabian Theis 將擔任此次合作的首席研究員。
Garnett 的研究團隊開發(fā)出新型的 3D 類器官培養(yǎng)模型，作為高度可擴展、功能強大的癌癥模型，可捕捉患者腫瘤的典型特征。該團隊將使用大量類器官——即培養(yǎng)皿中的微型腫瘤——作為模型，以更深入探究癌癥在治療下的可塑性與適應機制。
Theis 的團隊因在 AI 與單細胞基因組學交叉領域開創(chuàng)計算算法來解決復雜生物學挑戰(zhàn)而廣受認可，特別在藥物對細胞系統(tǒng)影響的計算機建模方面表現(xiàn)出色。該項目將在 Parse Biosciences 的 GigaLab 實驗室中展開，這是一個專為高速生成大規(guī)模單細胞 RNA 測序數(shù)據(jù)而設計的先進設施。
Sanger、Helmholtz Munich 和 Parse 團隊已開發(fā)出自動化方法來簡化實驗室程序，以及分析和發(fā)現(xiàn)此類規(guī)模數(shù)據(jù)集中洞察所需的計算方法。
該合作的最終目標是構建一個單細胞參考圖譜，實現(xiàn)虛擬細胞建模，進而預測抗癌藥物效果——包括哪些藥物可能導致耐藥、何時產(chǎn)生耐藥性、以及未來治療應該如何靶向等。
Wellcome Sanger Institute 團隊負責人兼項目聯(lián)合負責人 Garnett 博士表示：“我們已經(jīng)開發(fā)出一個變革性平臺，能夠實現(xiàn)大規(guī)模類器官篩選以及下游數(shù)據(jù)生成和分析，有望重新定義對癌癥治療反應的理解。我們將組建匯集學術與產(chǎn)業(yè)界頂尖專家的協(xié)作社區(qū)，推動項目發(fā)展。這種規(guī)模的研究對于開發(fā)基礎模型至關重要，有助于推動該領域的實質性進展�！�
項目聯(lián)合負責人、Helmholtz Munich 的 Computational Health Center 主任 Theis 指出：“隨著 AI 技術進步，虛擬細胞擾動模型的構想正逐步成為現(xiàn)實——但要實現(xiàn)規(guī)模效應，我們需要大量高質量的單細胞擾動數(shù)據(jù)集。這次合作提供了實現(xiàn)這一目標的路徑，我期待在藥物發(fā)現(xiàn)中實現(xiàn) AI 驅動的實驗設計。”
Parse Biosciences 的首席技術官 Charlie Roco 博士表示：“我們非常高興能將 GigaLab 的強大功能帶給這些具有前瞻性的合作伙伴。借助 Parse 自主研發(fā)的 Evercode 化學平臺，GigaLab 能快速生成大規(guī)模高質量的單細胞數(shù)據(jù)集。此次與 Wellcome Sanger Institute 和 Helmholtz Munich 合作，將科研實力與 GigaLab 的規(guī)模與速度結合起來，為從根本上改變我們對癌癥的理解提供了機會�！�
關于Parse Biosciences
Parse Biosciences是一家全球性的生命科學公司，以為人類健康和科學研究提速為使命。公司讓研究人員能夠以前所未有的規(guī)模和便利進行單細胞測序，借助創(chuàng)新性的實驗方法在癌癥治療、組織修復、干細胞治療、腎臟和肝臟疾病、大腦發(fā)育和免疫系統(tǒng)領域實現(xiàn)了突破性的進展。
Parse Biosciences 由 Alex Rosenberg 和 Charles Roco 于華盛頓大學共同創(chuàng)立，至今已籌集超過 1 億美元資金，全球已有 2500 多家客戶使用其產(chǎn)品。其產(chǎn)品組合包括： Evercode™ Whole Transcriptome、Evercode™ TCR、Evercode™ BCR、Gene Select 以及數(shù)據(jù)分析解決方案 Trailmaker™。
Parse Biosciences總部位于西雅圖充滿活力的 South Lake Union區(qū)，最近那里已擴建為一個全新的總部和最先進的實驗室。
關于 Helmholtz Munich
Helmholtz Munich 是全球領先的生物醫(yī)學研究中心，其使命是在快速變化的世界中開發(fā)突破性的健康解決方案。該跨學科研究團隊主要專注于環(huán)境誘發(fā)疾病，特別是糖尿病、肥胖、過敏和慢性肺部疾病的治療和預防。借助人工智能與生物工程技術，研究人員正加速科研成果向臨床應用的轉化。Helmholtz Munich 擁有約 2500 名員工，總部位于慕尼黑的諾伊爾貝格。它是 Helmholtz Association 的成員，該協(xié)會擁有超過43000名員工和18個研究中心，是德國最大的科學組織。
關于 Wellcome Sanger Institute
Wellcome Sanger Institute 是全球領先的基因組學研究中心，專注于開展大規(guī)模研究，構建生物學與醫(yī)學知識的基礎。我們秉持開放與協(xié)作的精神，將數(shù)據(jù)、成果、工具與技術在全球范圍內(nèi)共享，以推進科學發(fā)展。我們的目標雄心勃勃——致力于推進其他機構難以承擔的項目。在 Wellcome 的資助下，我們擁有拓展基因組學前沿的自由和支持力量，研究成果廣泛應用于改善人類健康和認知地球生命。
關于 Wellcome
Wellcome 致力于通過科學解決全球緊迫的健康挑戰(zhàn)。我們支持關于生命、健康與福祉的研究，并聚焦于三大全球性健康議題：心理健康、傳染病與氣候與健康。
